Unabhängig von der gewählten Methode wird das frische oder gefrorene Rohmaterial in Wasser (mindestens 3 Mal) gewaschen, um alle unerwünschten Verbindungen (Restblut, Fette, Fleischfetzen usw.) zu entfernen, und dann in einem kalten elektrischen Trockner getrocknet, bevor es gemahlen wird.
Die saure Extraktion von Kollagen, das am häufigsten verwendete Verfahren in der Industrie, erfordert vorbehandlungen zur Entproteinisierung und Entmineralisierung. Bei der Entproteinisierung wird das rohe Ausgangsmaterial, das zuvor gereinigt wurde, in eine basische Lösung (Natriumhydroxid, Calciumhydroxid usw.) eingetaucht, die je nach Herkunft des extrahierten Gewebes variiert, in hohen Konzentrationen bis zu 24 Stunden bei 4°C unter Rühren. Dieser Schritt ermöglicht es, nicht-kollagene Proteine zu entfernen, um zufriedenstellende Ausbeuten und ein Kollagen mit einem hohen Reinheitsgrad zu erhalten, ohne seine strukturelle Integrität zu beeinträchtigen.
Je nach verwendeter Rohstoff kann die Probe zu einer Buttersäurelösung hinzugefügt werden, um überschüssiges Fett zu entfernen.
Das alkalische Bad wird von einer Wasserwäsche gefolgt, um überschüssige basische Formel zu entfernen, und einer Filtration, um den deproteinierten Rückstand zu sammeln. Nach der Deproteinierung folgt der Schritt der Demineralisierung, um so viele Mineralien wie möglich zu entfernen. Hierfür können zwei Säuren verwendet werden: Salzsäure (HCl) und EDTA, und dieser Prozess kann bis zu 48 Stunden dauern. Die deproteinierte, demineralisierte und neutralisierte Rohstoff wird dann zu einer sauren Formel (Essigsäure, Zitronensäure, Milchsäure usw.) hinzugefügt und für 24 bis 72 Stunden, abhängig vom Rohstoff, unter ständigem Rühren bei 4°C gehalten, um das nicht-vernetzte Kollagen zu solubilisieren und einige Bindungen zu brechen.
Das so erhaltene Kollagenhydrolysat wird dann einer Ultrafiltration unterzogen, um ungelöste große Aggregate zu entfernen. Dies ist eine fortschrittliche Filtrationsmethode, bei der die Flüssigkeit unter hohem Druck durch eine Reihe von Membranen/Maschen mit mikroskopischen Öffnungen gepresst wird, um eine größere Reinheit und eine bessere Stabilität des Produkts zu gewährleisten und das Risiko einer Kontamination zu minimieren. Kollagenpeptide mit niedrigem Molekulargewicht passieren auf die andere Seite, während Verunreinigungen (Spuren von Schwermetallen usw.) zurückgehalten und entsorgt werden.
Der gewonnene Überstand wird dann durch Zugabe eines neutralen Salzes, vorzugsweise Natriumchlorid (NaCl), selektiv ausgefällt, für mindestens 12 Stunden bei niedriger Temperatur ohne Rühren, bevor er wieder in Essigsäure suspendiert wird. Es folgt schließlich die Entfernung des Salzes durch Dialyse mit Hilfe eines Dialysebeutels und das Trocknen der Flüssigkeit in Pulverform (Lyophilisation) durch Zerstäubung oder Sprühen.